Defensa del TFM de Manuel Alfonso López Rourich sobre ultra-secuenciación genética en un centro de supercomputación

El pasado Miércoles, 3 de Septiembre Manuel Alfonso López Rourich ha presentado el Trabajo Fin de Máster “Propuesta y análisis de viabilidad de un sistema automatizado de diagnóstico e investigación aplicado a la tecnología de ultra-secuenciación genética en un centro de supercomputación”, dentro del Máster Universitario en Investigación (MUI), especialidad Tecnologías Informáticas y de Comunicaciones (TINC), dirigido por José Luis González Sánchez (Director de COMPUTAEX) y Pablo García Rodríguez. Antes de la presentación nos quedamos sin luz en todo el campus, y tuvimos que improvisar para hacer la presentación con un cañón de vídeo portátil, y en una sala con enchufes a una de las SAIs del centro.

El Trabajo consiste en el diseño y desarrollo de un entorno semi-automático para trabajar con secuencias de experimentos de resecuenciación genética, de tal manera que el procesamiento de las mismas se hace automáticamente, y se proporcionan herramientas para que los genetistas puedan predecir e interpretar, cuando sea posible, la patogenicidad de las variaciones detectadas.

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Manuel Alfonso es técnico de apoyo, en la Fundación COMPUTAEX, en el proyecto europeo FI4VDI (Federation Infrastructure –Virtual Desktop Infrastructure). En el proyecto se está desarrollando una red federada de infraestructuras a través de la cual sus usuarios puedan desplegar máquinas virtuales donde puedan llevar a cabo tareas relacionadas con su trabajo diario. El entorno presentado en el Trabajo Fin de Máster será uno de los prototipos para el FI4VDI.

Además, este entorno se presentará la próxima semana el martes 9 de septiembre en IberGrid 2014, en Aveiro, enmarcado en la sesión “Clouds for e-Science”:

http://www.computaex.es/noticias/05092014-computaex-presenta-articulo-secuenciacion-genetica-ibergrid-2014

 

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pablogarguez

@pablogarguez es actualmente #Investigador y Profesor Titular de Ingeniería Informática de la Escuela Politécnica en la Universidad de Extremadura en Cáceres. Ha sido Director General de Agenda Digital de la Consejería de Economía, Ciencia y Agenda Digital de la Junta de Extremadura, desde septiembre de 2019 a agosto de 2023. Fue Director de la Escuela Politécnica de Cáceres (School of Technology) de la Universidad de Extremadura durante 3 años (2017-2019), con titulaciones de grado, máster y doctorado en los campos de Ingeniería Civil, Edificación, Informática y Telecomunicaciones. Su trayectoria docente comienza en 1997 básicamente en asignaturas de Programación y de Bases de Datos. Su actividad investigadora se ha centrado en el Reconocimiento de Patrones y la Ciberseguridad. Fruto de esta labor de investigación, resaltar que es coautor de más de veinte artículos publicados en revistas internacionales indexadas en JCR, con un índice H de 12 en cuanto a las citas conseguidas por estos artículos. Actualmente tiene 3 sexenios de investigación a nivel nacional, y el último de ellos es un sexenio vivo (activo). También posee un sexenio de transferencia en la única convocatoria abierta hasta ahora por el Ministerio (2019).

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